Zanim jednak utworzymy jakiekolwiek menu czy mapę witryny, pomyślmy nad jej strukturą, aby umożliwiła jak najlepsze pozycjonowanie naszych stron.
Sprawa jest prostsza w przypadku systemów typu CMS, gdyż one często wymuszają swój własny model, choć nie zawsze musi to być użyteczne. Generalnie jednak stosuje się podział na sekcje, takie jak np. nowości, katalog, wyszukiwarka, forum czy blogi oraz parę stron statycznych, jak wspomniane już strony pomocowe czy kontaktowe. Te ostatnie przydają się szczególnie dla odbiorców końcowych, czyli ludzi wchodzących na nasze strony przez wyszukiwarkę lub bezpośrednio, gdyż pokażą im, że poważnie myślimy o ich potrzebach. Pozycjonowanie to w końcu nie wszystko - co nam po nim, jeżeli nasi goście będą wychodzić z naszego sajtu od razu po wejściu na niego?
Gdzie umieścić menu? Najlepiej po lewej albo na górze, choć spotykane są też strony, na których jest ono na dole lub po prawej. Dla Googli żadnej roli nie gra to, gdzie będzie ono widoczne na ekranie; warto natomiast umieścić je fizycznie na początku kodu HTML, aby pozycjonowanie było lepsze, a ustawienie na stronie dopasować z użyciem CSS-ów. Wyszukiwarka Google łatwiej zauważy bowiem menu, które rozpoczyna zawartość strony, niż takie, które jest wciśnięte gdzieś na końcu.